Panama Kanalı'nın konumu, tarih boyunca deniz taşımacılığı açısından stratejik bir öneme sahip olmuştur. Bu önemli su yolu, iki okyanusu birleştirerek deniz trafiğini kolaylaştırırken, Panama'nın coğrafi yapısı sayesinde inşa edilmesi de daha mantıklı hale gelmiştir. Bu durum, hem ticaret hem de ulaşım açısından büyük avantajlar sağlamaktadır.
Panama Kanalı, Orta Amerika'da, Panama'da bulunmaktadır çünkü bu bölge, Atlantik Okyanusu ile Pasifik Okyanusu'nu birbirine bağlayan en uygun coğrafi noktada yer almaktadır.